Skip to content

Profil mRNA w komórkach układu moczowego i ostre odrzucenie komórek w przeszczepie nerki AD 4

2 tygodnie ago

514 words

W Suplemencie Dodatkowym wymieniono wyniki wszystkich próbek biopsji 410, które były odpowiednie do diagnozy opartej na biopsji. Pacjenci, którzy nie przeszli biopsji, zostali sklasyfikowani jako posiadający stabilną funkcję przeszczepu, jeśli średni poziom kreatyniny w surowicy był mniejszy lub równy 2,0 mg na decylitr (180 ?mol na litr) w przypadku dostępnych ocen 6, 9 i 12 miesięcy po transplantacji, bez utrata przeszczepu lub zgon w ciągu pierwszych 12 miesięcy po transplantacji, brak leczenia ostrego odrzucenia i brak dowodów na zakażenie wirusem cytomegalii (CMV) lub poliomawirusem typu BK (BKV).
Zestaw danych z walidacją zewnętrzną
Dopasowane próbki moczu dla wszystkich 24 próbek biopsyjnych wykazujących ostre odrzucenie komórek zgodnie ze schematem Banffa i losową selekcję 47 próbek biopsyjnych nie wykazujących dowodów odrzucenia, uzyskanych od 64 biorców nerki przeszczepionych do sponsorowanych przez NIH badań klinicznych w Badanie przeszczepu narządów 01 (CTOT-01) zostało wykorzystane przez analizę statystyczną i kliniczne centrum koordynacyjne do skonstruowania zestawu danych do walidacji zewnętrznej. Charakterystyka 64 pacjentów (tabela S2B w dodatkowym dodatku) i szczegóły zewnętrznego badania walidacyjnego znajdują się w dodatkowym dodatku.
Analiza statystyczna
Każda miara mRNA była analizowana przed i po normalizacji za pomocą kopii 18S rRNA (x 10-6) na mikrogram całkowitego RNA, a następnie log10-transformowana w celu zmniejszenia dodatniego pochylenia. Testy Kruskala-Wallisa i Manna-Whitneya wykorzystano do porównania poziomów w diagnozach.
Regresja logistyczna została wykorzystana do zidentyfikowania sprytnych podzbiorów ośmiu 18R-normalizowanych mRNA mierzonych – CD3?, perforyna, granzym B, inhibitor proteazy 9, CD103, IP-10, CXCR3 i TGF-?1 – i 18S rRNA z dopasowanych próbek moczu, które dyskryminowały między próbkami biopsyjnymi wykazującymi ostre odrzucenie komórkowe a tymi, które nie wykazują odrzucenia. Ostre odrzucenie komórkowe zdefiniowano jako odrzucenie stopnia IA Banffa lub wyższego, a próbki do biopsji, które nie wykazywały odrzucenia, zostały sklasyfikowane przez patologa na miejscu jako nie wykazujące histologicznych cech odrzucenia (Tabela S5 w Dodatku Aneks). Z tych modeli, w których każdy czynnik prognostyczny był znaczący przy wartości P mniejszej niż 0,05, tymczasowo wybraliśmy ten, który ma największy współczynnik wiarygodności logów i największy obszar pod krzywą charakterystyki działania odbiornika (ROC) jako najlepiej dopasowany model.8 Oceny regresji z tego modelu określają sygnaturę diagnostyczną, a wykorzystaliśmy pole pod krzywą (AUC), czułość i swoistość, aby ocenić zdolność tego podpisu do rozróżniania próbek biopsyjnych wykazujących ostre odrzucenie komórkowe i tych, które nie wykazują odrzucenia .
Możliwość uogólnienia dopasowanego modelu do innych zestawów danych została oceniona za pomocą metod ponownego próbkowania bootstrap9. Regresja logistyczna z eliminacją wsteczną została wykorzystana do zidentyfikowania najlepszego podzbioru mierzonych 18S miar mRNA i miary 18S rRNA w każdym z 500 danych. zestawy otrzymane przez próbkowanie z zamiennikiem z oryginalnego zestawu danych. 10 Najlepszy model podzestawu został następnie dopasowany do 500 dodatkowych próbek początkowego ładowania, z których zweryfikowano krzyżowo 9 miar dyskryminacji (tj. AUC) i dopasowania modelu (tj. przechwycenie krzywej kalibracyjnej i nachylenie) 8 i uzyskano miejscowo oszacowany wykres kalibracji wykresu rozrzedzonego (less) (less).
Porównaliśmy potencjalne trajektorie sygnatury diagnostycznej w trzech grupach
[patrz też: okulary do czytania i komputera, klinika ortodontyczna warszawa, badania w rodk wzory ]

0 thoughts on “Profil mRNA w komórkach układu moczowego i ostre odrzucenie komórek w przeszczepie nerki AD 4”

Powiązane tematy z artykułem: badania w rodk wzory klinika ortodontyczna warszawa okulary do czytania i komputera