Skip to content

Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby

2 miesiące ago

472 words

Wyzwaniem jest identyfikacja pacjentów, u których po potencjalnym leczeniu nowotworu wątrobowokomórkowego występuje największe ryzyko nawrotu. Pacjenci tak wysokiego ryzyka mogli otrzymać nowe środki interwencyjne. Przeszkodą w opracowaniu opartych na genomie czynników predykcyjnych wyników u pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym jest brak możliwości prowadzenia profilowania ekspresji genomowej w tkance stałej, w przeciwieństwie do zamrożonej. Metody
Naszym celem było zademonstrowanie możliwości profilowania ekspresji genów ponad 6000 ludzkich genów w utrwalonych w formalinie tkankach zatopionych w parafinie. Zastosowaliśmy tę metodę do tkanek od 307 pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym, od czterech serii pacjentów, aby odkryć i zweryfikować sygnaturę ekspresji genów związaną z przeżyciem.
Wyniki
Metoda profilowania ekspresji dla utrwalonej w formalinie, zatopionej w parafinie tkanki była bardzo skuteczna: próbki od 90% pacjentów dały dane o wysokiej jakości, w tym próbki, które były archiwizowane przez ponad 24 lata. Profile ekspresji genów w tkance guza nie dały znaczącego związku z przeżyciem. Dla kontrastu, profile okolicznej nietoczułej tkanki wątroby były silnie skorelowane z przeżyciem w zestawie treningowym próbek tkanek od 82 japońskich pacjentów, a podpis potwierdzono w tkankach z niezależnej grupy 225 pacjentów ze Stanów Zjednoczonych i Europy (P = 0,04).
Wnioski
Wykazaliśmy wykonalność profilowania ekspresji genomewidów w tkankach utrwalonych w formalinie, zatopionych w parafinie i wykazaliśmy, że powtarzalna sygnatura ekspresji genu skorelowana z przeżyciem występuje w tkance wątroby przylegającej do guza u pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym.
Wprowadzenie
W krajach rozwijających się rak wątrobowokomórkowy często przychodzi na pomoc medyczną, gdy nowotwory znajdują się w zaawansowanym stadium, a terapia lecznicza przynosi ograniczone korzyści. Jednak w krajach rozwiniętych zagrożone populacje pacjentów (np. Zakażonych wirusem zapalenia wątroby i mających marskość) są często pod ścisłą kontrolą; w rezultacie rak wątrobowokomórkowy jest zwykle wykrywany, gdy guzy są małe, a leczenie jest bardziej prawdopodobne.1.2 Niemniej jednak, u większości pacjentów ostatecznie dochodzi do nawrotów.1,2 Badania sugerują, że strategie chemioterapeutyczne mogą tłumić nawroty i przedłużać przeżycie, 1,3-6, choć ustalenia te są nadal niepewne. Idealne byłoby leczenie tylko pacjentów o największym ryzyku nawrotu. Zastosowano kilka metod przewidywania przeżywalności u pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym, w tym wyliczenie cech anatomicznych i histopatologicznych (np. Guza o wielu rozmiarach i inwazji naczyniowej), ale stały się one mniej użyteczne, ponieważ rak wątrobowokomórkowy jest coraz częściej diagnozowany na wcześniejszych etapach.
Wyzwaniem technicznym stojącym przed zastosowaniem profilowania ekspresji genów do przewidywania wyniku raka wątrobowokomórkowego był brak odpowiednich próbek od pacjentów. Obecne metody profilowania ekspresji genomu wymagają zmrożonej tkanki do analizy, podczas gdy banki tkanek z danymi dotyczącymi wyników klinicznych na ogół mają utrwalone w formalinie, zatopione w parafinie próbki.
[więcej w: rezonans kręgosłupa cena, gorset allegro, pogoda długoterminowa bolesławiec ]

0 thoughts on “Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby”

Powiązane tematy z artykułem: gorset allegro pogoda długoterminowa bolesławiec rezonans kręgosłupa cena