Skip to content

Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby czesc 4

2 miesiące ago

499 words

Ponadto, poprzednio zgłoszona sygnatura związana z przeżyciem wśród pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym15 nie była związana z przeżyciem w naszej serii pacjentów (P = 0,76) (Figura 2B w dodatkowym dodatku). To niepowodzenie identyfikacji sygnatury związanej z wynikiem jest mało prawdopodobne z powodu technicznej słabości utrwalonej w formalinie, zatopionej w parafinie metody DASL, ponieważ zaobserwowaliśmy tę samą strukturę subklasy molekularnej w utrwalonych w formalinie, zatopionych w parafinie próbkach, co obserwowane w kolekcjach zamrożonych próbek raka wątrobowokomórkowego (ryc. 2B i 3B w dodatkowym dodatku). Chociaż ten wynik nie wyklucza możliwości uzyskania profili ekspresji pochodzących od nowotworów jako czynników predykcyjnych wyniku raka wątrobowokomórkowego, dane sugerują, że przynajmniej w tym zestawie treningowym wynik był w dużej mierze związany z innymi czynnikami. Survival Signature w sąsiedniej tkance wątroby
Brak związku między profilami ekspresji genów pochodzących z guza a przeżyciem doprowadził do rozważenia wzorca nawrotu wczesnego stadium raka wątrobowokomórkowego. W przeciwieństwie do zaawansowanych nowotworów, które mają tendencję do nawrotów szybko po resekcji, nowotwory we wczesnym stadium, które są coraz częściej diagnozowane we współczesnej praktyce klinicznej, powracają znacznie później, zwykle ponad 2 lata po resekcji9,10 (Figura 4 w Dodatku Uzupełniającym). Ten pojawiający się wzorzec późnego nawrotu raka wątrobowokomórkowego (co najmniej częściowo spowodowany rozpoznaniem raka wątrobowokomórkowego we wczesnym stadium) doprowadził do tego, że późna nawrotowa może nie być rzeczywistą nawrotem, ale raczej drugim pierwotnym guzem w -występuje wątroba, prawdopodobnie ze względu na rakotwórcze działanie marskości.1,2,9 Dlatego postawiliśmy hipotezę, że otaczająca tkanka wątroby – a nie sam nowotwór – może zawierać sygnaturę ekspresji genu związaną z późniejszym nawrotem.
Rysunek 2. Rysunek 2. Krzywe przetrwania i krzywe przeżycia w zbiorze treningowym. Pokazano krzywe przeżycia zgodnie ze skojarzeniem sygnatury genu z przeżyciem, w oparciu o testy eliminacji krzyżowej (panel A) i dla całkowitego przeżycia według poziomu ekspresji genów z 186 ); z tych 113 było związane z dobrym rokowaniem i 73 ze złym rokowaniem. Panel C pokazuje wzór ekspresji sygnatury przeżycia (zawierającej 186 genów). 20 genów najbliżej związanych ze złym rokowaniem jest wymienionych po lewej stronie, a 20 najbliżej związanych z dobrym rokowaniem po prawej stronie. Kolor czerwony oznacza wysoką ekspresję; niebieski oznacza niską ekspresję. Panel D pokazuje reprezentatywne fotomikrografie przekrojów tkanki wątroby sąsiadujących z guzem, które zostały profilowane w tym badaniu; nie było żadnych histologicznych korelatów z przeżyciem. Barwienie przeprowadzono z użyciem hematoksyliny i eozyny.
Aby przetestować tę hipotezę, oceniliśmy profile ekspresji genów tkanki wątroby otaczające wycięty guz w 106 unieruchomionych formaliną blokach zatopionych w parafinie, które stanowiły zestaw treningowy. Osiemdziesiąt dwie próbki (77%) dały wysokiej jakości profile ekspresji genów (patrz Dodatek dodatkowy). Korzystając ze standardowej procedury sprawdzania krzyżowego, stwierdziliśmy, że sygnatura wątroby jest istotnie skorelowana z czasem przeżycia (p = 0,02) (ryc. 2A)
[hasła pokrewne: pogoda długoterminowa bolesławiec, medicus opole rejestracja, prywatne ośrodki leczenia alkoholizmu ]

0 thoughts on “Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby czesc 4”

Powiązane tematy z artykułem: medicus opole rejestracja pogoda długoterminowa bolesławiec prywatne ośrodki leczenia alkoholizmu