Skip to content

Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby ad 7

1 miesiąc ago

550 words

Wyniki te silnie sugerują, że pierwotne i nawracające nowotwory raka wątrobowokomórkowego powstają z różnych klonów. Dyskusja
Pełny potencjał profilowania ekspresji genów w nowotworach został częściowo ograniczony przez ograniczenia techniczne – w szczególności wymóg zamrożonego materiału do analizy. Chociaż zamrożone tkanki są coraz częściej bankowane w ośrodkach opieki trzeciego stopnia, czas trwania obserwacji klinicznej tych zbiorów jest zwykle krótki, a znaczna większość próbek i resekcji guza wykonuje się poza dużymi szpitalami badawczymi. Istnieje zatem zapotrzebowanie na metody, które pozwolą na profilowanie ekspresji genomowej próbek utrwalonych w formalinie, które są rutynowo zbierane w warunkach klinicznych. Takie podejście zostało opisane 17, ale ich szerokie zatwierdzenie nie zostało jeszcze zgłoszone. Opisujemy tutaj metodę opartą na DASL, zdolną do profilowania około 6000 ludzkich transkryptów, i przetestowaliśmy tę metodę na ponad 2000 utrwalonych w formalinie, zatopionych w parafinie blokach zebranych aż 24 lata temu. Poprzez test 6000 genów w całym genomie, które wykazują maksymalną zmienność ekspresji, oczekuje się, że to podejście będzie wychwytywać większość różnic transkrypcyjnych w dowolnym zbiorze próbek. Jednak ostatnie wzrosty gęstości macierzy wspierają analizę wszystkich ludzkich genów na pojedynczej macierzy (test DASL całego genomu, Illumina).
Opartą na DASL metodę wykrywania, którą tutaj opisujemy, należy odróżnić od metod profilowania kandydatów do genów opartych na teście odwrotnej transkryptazy (RT) -PCR, takich jak te stosowane w komercyjnie dostępnym teście OncotypeDx do określania rokowania u pacjentów z rakiem piersi .18 Podczas gdy standardowe metody RT-PCR mogą mierzyć niewielką liczbę transkryptów w próbkach utrwalonych w formalinie i zatopionych w parafinie, badania odkrycia genomowego nie są możliwe przy użyciu metod opartych na RT-PCR. Ponadto spekulujemy, że zastosowanie utrwalonych w formalinie, zatopionych w parafinie próbek tkanek pomoże przejść od badań eksploracyjnych do wdrożenia klinicznego.
Zastosowaliśmy metodę profilowania DASL w coraz ważniejszym wyzwaniu w opiece nad pacjentami z rakiem wątrobowokomórkowym. Guzy są często małe w momencie rozpoznania (ze względu na zwiększony nadzór i zaawansowaną diagnostykę u pacjentów z ryzykiem), a istniejące czynniki prognostyczne są mniej informatywne dla pacjentów z małymi guzami niż dla pacjentów z większymi nowotworami.
Nie obserwowaliśmy istotnego związku między profilami ekspresji samych guzów a wynikami u pacjentów z chirurgicznie wyciętym wczesnym rakiem wątrobowokomórkowym. W przeciwieństwie, inni opisali nowotworowe wskaźniki prognostyczne dla raka wątrobowokomórkowego.15,19 Jednak populacje pacjentów w tych badaniach wykazywały tendencję do bardziej zaawansowanej choroby. Nasz zestaw treningowy wykazywał przede wszystkim wzór późnego nawrotu, który jest typowy dla małych guzów.19 W związku z tym prawdopodobne jest, że wczesna nawrotowa (odzwierciedlająca miejscowo inwazyjny i niecałkowicie wycięty guz) jest związana z cechami molekularnymi guza pierwotnego, ale takie cechy nie są związane z późnymi nawrotami, które wydają się wynikać z nowych guzów pierwotnych powstających w uszkodzonym narządzie ( efekt polowy ), a nie z proliferacji resztkowych komórek nowotworowych pochodzących z pierwotnego guza.
Wspierając także koncepcję, że późny nawrót raka wątrobowokomórkowego stanowi nowe pierwotne nowotwory u pacjentów z grupy ryzyka, odkryliśmy niewielką korelację między cechami molekularnymi guzów wyciętych w początkowej diagnozie a tymi z tych samych pacjentów w momencie nawrotu choroby.
[przypisy: prywatne ośrodki leczenia alkoholizmu Warszawa, prywatne ośrodki leczenia alkoholizmu, korony cyrkonowe ]

0 thoughts on “Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby ad 7”

  1. [..] Blog oznaczyl uzycie nastepujacego fragmentu hurtownia włosów naturalnych katowice[…]

  2. Niedoczynność tarczycy to dość uciążliwa choroba i trzeba brać leki praktycznie cały czas

Powiązane tematy z artykułem: korony cyrkonowe prywatne ośrodki leczenia alkoholizmu rezonans kręgosłupa cena