Skip to content

Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby ad 5

2 miesiące ago

483 words

Sygnatura skorelowana z przeżywaniem zawierała 186 genów (rysunek 2B i 2C oraz tabela 2 w dodatkowym dodatku) i została przetestowana w zbiorze walidacyjnym. Stosując GSEA, który pokazuje, czy określony zestaw genów ma znaczący związek z fenotypem będącym przedmiotem zainteresowania, stwierdziliśmy, że dobry sygnalizator zawiera geny związane z prawidłową czynnością wątroby (Tabela 2 i Tabela 3 w dodatkowym dodatku), w tym białka osocza C4, C5, C8, C9 i F9 oraz kilka enzymów metabolizujących leki: alkohol dehydrogenaz ADH5 i ADH6, aldo-keto-reduktazy AKR1A1 i AKR1D1, dehydrogenaza aldehydowa ALDH9A1, cytochrom P450 CYP2B6 i lipaza wątrobowa ( LIPC). Odkrycia te są zgodne ze związkiem między upośledzoną funkcją wątroby a słabym wynikiem1. Ponadto, zła sygnatura prognostyczna zawiera zestawy genów związane ze stanem zapalnym, w tym te związane z sygnalizowaniem interferonu, aktywacją czynnika jądrowego .B i sygnalizacją przez nowotwór. czynnik martwicy .. Nie stwierdzono związku histologicznego cech zapalenia wątroby z wynikiem leczenia (rysunek 2D oraz tabela 4 i rysunek 5 w dodatkowym dodatku). Szczególnie interesujące badanie GSEA wykazało, że dolne poziomy docelowe interleukiny-6 były silnie związane z sygnaturą o złym rokowaniu, co jest zgodne ze stwierdzeniem, że zakłócenie sygnalizacji interleukiny 6 chroni myszy przed chemicznie wywołanym rakiem wątrobowokomórkowym. Walidacja podpisu dotyczącego przetrwania wątroby
Rysunek 3. Rysunek 3. Krzywe przetrwania i krzywe przeżycia w zestawie walidacyjnym. Panel A pokazuje wzór ekspresji sygnatury przeżycia 186-genu. Kolor czerwony oznacza złe prognozy; niebieski oznacza dobre rokowanie. Krzywe przeżycia przedstawiono dla całkowitego przeżycia w zależności od poziomu ekspresji 186 genów sygnaturowych wśród wszystkich 225 pacjentów, których próbki tkanek stanowiły zestaw walidacyjny (panel B) i wśród 168 pacjentów z dłuższym okresem obserwacji (leczonych nie później). niż w 2004 r.) (panel C). Panel D pokazuje prawdopodobieństwo późnej nawrotu w zależności od poziomu ekspresji sygnatury genu późnego nawrotu. Brak danych dla jednego pacjenta w panelu D.
Następnie przetestowaliśmy sygnaturę przeżycia 186-genu w niezależnym zestawie próbek tkanek od kwalifikujących się pacjentów w trzech centrach leczenia w Stanach Zjednoczonych i Europie. Spośród 234 próbek w tym zestawie walidacyjnym, 225 (96%) dało profile ekspresji genów o wysokiej jakości (patrz dodatek dodatkowy). Podpis przeżycia (ryc. 3A) był związany ze znacznymi różnicami w przeżyciu wśród pacjentów (P = 0,04) (ryc. 3B), pomimo skromnego czasu obserwacji (mediana, 2,2 roku). Oddzielenie krzywych przeżycia było jeszcze bardziej wyraźne, gdy w analizie podgrupy z ograniczoną analizą ograniczyliśmy naszą uwagę do 168 pacjentów z dłuższym okresem obserwacji (mediana, 2,8 roku, P = 0,01) (Figura 3C). Wyniki te potwierdzają ważność sygnatury przeżycia i podkreślają potencjalną rolę niedotlenionej tkanki wątroby w przewidywaniu wyniku u pacjentów z wczesnym rakiem wątrobowokomórkowym.
Podpis związany z powtarzaniem
Przeprowadziliśmy podobną analizę, stosując nawrót guza jako kliniczny punkt końcowy
[patrz też: rezonans kręgosłupa cena, motto allegro, ile kosztuje badanie dna ]

0 thoughts on “Ekspresja genów w tkankach stałych i wynik w komórkach wątroby ad 5”

Powiązane tematy z artykułem: ile kosztuje badanie dna motto allegro rezonans kręgosłupa cena